在《楞严经》中，药王菩萨和他的兄弟药上菩萨，曾向大众自述证悟佛法的真正因缘：

“我无始劫为世良医，口中尝此娑婆世界草木金石，名数凡有十万八千……承事如来，了知味性，非空非有，非即身心，非离身心，分别味因，从是开悟。蒙佛如来印我昆季药王、药上二菩萨名。今于会中为法王子，因味觉明位登菩萨。佛问圆通，如我所证，味因为上！”

佛门誉为“经中之王”的《法华经》上，专列一章节《药王菩萨本事品》，来记载药王菩萨往昔与《法华经》的甚深因缘，其中最著名的，就是药王菩萨燃身供佛的故事：

过去无量阿僧祇劫前，有一位“一切众生喜见菩萨”（药王菩萨前身），听闻“日月净明德佛”讲《法华经》，精进修行，而证得一切色身三昧。为上报佛恩，供养日月净明德佛及《法华经》，这位菩萨服食各种香料，又用香油涂身，在日月净明德佛的座前，用神通愿力，自燃其身，光明遍照八十亿恒河沙世界。其身燃烧了一千二百年，方才燃尽，诸佛如来盛赞其“真法供养如来”，是“第一之施”。

药王菩萨燃身供佛的故事，还启发过智者大师。

道宣律师《续高僧传》卷十七记载：天台智者大师持诵《法华经》，心缘苦行，至药王菩萨焚身处，解悟便发，于此豁然前后际断，证法华三昧，亲见佛陀灵山一会，俨然未散。

民国四大高僧之一，印光法师对药王菩萨的大行，有着精到论述：

“如来于法华、楞严、梵网等大乘经中，称赞苦行，令其然身臂指，供养诸佛，对治贪心及爱惜保重自身之心。此法于六度中仍属布施度摄。以布施有内外不同，外则国城妻子，内则头目髓脑，然香然身，皆所谓舍，必须至心恳切，仰祈三宝加被。唯欲自他业消慧朗，罪灭福增，则功德无量无边，不可思议。如若心慕虚名，徒以执著之心，效法除著之行，且莫说然臂香，即将全身通然，亦是无益行。”