鉴真是日本佛教律宗的开山始祖，今天日本的佛教流派中，大多不排斥吃肉娶妻。鉴真创建的唐招提寺中的律宗寺僧，依然是日本除临济宗总坛以外仅有的严守戒律的僧侣。这也算是鉴真给日本佛教界留下的一大遗产吧。

鉴真通晓医学，精通本草，他把我国中药鉴别、炮制、配方、收藏、应用等技术带到了日本，并传授医学，热忱为患者治病。

当时鉴真虽已双目失明，但他以口尝、鼻嗅、手摸来鉴别药物真伪，辨之无误，人称为汉方医药始祖，日本之神农。十七、十八世纪时，日本药店的药袋上，还印着鉴真的图像，可见影响之深。

鉴真的东渡弟子及随行人员中，有不少是精通建筑技术的。在鉴真的设计及领导下，建造了著名的唐招提寺。由于鉴真僧众采用了唐代最先进的建筑方法，因而这座建筑异常牢固精美，经过一千二百余年的风雨，至今屹立如初，成为研究了解中国古代建筑艺术的最有价值的珍贵实物。

鉴真及其弟子在书法方面也有很深的造诣，他东渡时携带了王羲之的行书真迹一幅（丧乱帖）、王献之的行书真迹三幅，以及其他各种书法50卷。这对日本书道的形成起到了极大的促进作用。鉴真本人也是书法名家，其“请经书贴”被誉为日本国宝。

日本僧俗人众热情欢迎来自中国的高僧。第二年鉴真一行被迎入日本都城奈良最著名的东大寺。天皇亲自下诏称：“自今以后，授戒传律，一任和上（和尚）。”同时授予“传灯大法师”位。

四月，鉴真大师在东大寺筑坛举行隆重法会，为圣武上皇，孝谦天皇、皇后，皇太子及僧俗四百余人传授了戒律，大师成为日本戒法的开山祖。鉴真大师后在东大寺大殿西侧建成戒坛院，接着又主持了兴建奈良唐招提寺的规划工作。

招提寺仿照唐代佛寺的建筑制式规模，采用唐代先进的建筑工艺流程，于天平宝字三年（759年）建成。鉴真大师同时也将中国的佛像塑制艺术、医药、书法、文学传授到了日本。

唐肃宗宝应元年（763年）由于长期积劳，鉴真病重。五月六日，大师双腿盘空，面向西方的祖国圆寂。终年七十六岁。死后三日，体温犹在，人呼真菩萨。