慈云寺位于依兰县城西北，北依松花江。是奉系军阀依兰镇守使李杜为其妹在龙王庙基础上修建的。寺建筑坐北朝南，布局有主有次，层次分明。主体建筑由3层殿宇组成，即四王殿、三圣殿、龙王殿，自南向北整齐地排列在一条中轴线上。三殿均为单檐硬山式建筑，殿前有券棚相接，为圆脊扣青瓦。1990年又修建了钟鼓楼和比丘尼塔等，使布局更加严谨和完善。

据记载、民国十七年（一九二八年），依兰镇镇守史李杜将军建立此寺，供其姐夫清莲法师修行，属曹洞宗。一九八八年宝谛法师重修。现有山门、钟楼、鼓楼、天王殿、大雄宝殿、藏经室、客堂、齐堂、僧寮、佛学院等。天王殿和大雄宝殿是县级文物保护单位，有一株三百佘年的大榆树，古木又参天。又有塔林二座，供奉舍利一粒，珍藏《大正藏》一部。  

现任住持寂宏法师，三十佘岁，黑龙江省海伦县人，一九八八年出家，师从宝谛法师，毕业于依兰佛学院，兼任黑龙江省佛教协会常务理事，哈尔滨市佛教协会理事。